Ειδικές ρυθμίσεις περιλαμβάνει το συμβόλαιο με τον εργολάβο για τα έργα τα οποία αφορούν την αναβάθμιση και επέκταση των εγκαταστάσεων και υποδομών στο Νοσοκομείο Αρχιεπίσκοπος Μακάριος ΙΙΙ, ώστε να μην επηρεαστεί η υγεία των παιδιών που βρίσκονται στην Παιδογκολογική Κλινική καθώς και άλλες κλινικές του Νοσοκομείου.
Ο Γιώργος Κουκουμάς, βουλευτής του ΑΚΕΛ, έστειλε επιστολή για το θέμα στον Υπουργό Υγείας, Μιχάλη Δαμιανό, επισημαίνοντας τις ιδιαιτερότητες τις οποίες παρουσιάζει το συγκεκριμένο έργο και την ανάγκη για λήψη μέτρων για προστασία των ασθενών και ιδιαίτερα των παιδιών.
Στην απαντητική του επιστολή ο Μ. Δαμιανός διαβεβαιώνει ότι στο συμβόλαιο με τον εργολάβο έχουν περιληφθεί «όροι και τεχνικές προδιαγραφές, ώστε να μην επηρεαστεί η υγεία των παιδιών που βρίσκονται στην Παιδογκολογική Κλινική αλλά και στις άλλες κλινικές του Νοσοκομείου». Αναφέρει επίσης ότι ο ΟΚΥπΥ βρίσκεται στη διαδικασία εγκατάστασης συστημάτων εξαερισμού με τη χρήση ΗΕΡΑ FILTERS, προκειμένου να αυξηθούν τα μέτρα ασφαλείας των ανοσοκατασταλμένων παιδιών. Αναφέρει επίσης ότι έχει συσταθεί Διεπιστημονική Επιτροπή για την πρόληψη και έλεγχο λοιμώξεων που συνδέονται με κατασκευαστικές εργασίες. Ακόμη, αναφέρει ότι μέσα από συμβόλαιο ο εργολάβος ανέλαβε την υποχρέωση να δίνει επαρκή ειδοποίηση για οποιεσδήποτε σχεδιαζόμενες δραστηριότητες προτού ξεκινήσουν, ώστε να γίνεται αξιολόγηση κινδύνου και να μπορούν να λαμβάνονται έγκαιρα τα κατάλληλα προληπτικά μέτρα για προστασία των ευάλωτων ασθενών. Επιπρόσθετα, για εργασίες εντός του νοσηλευτηρίου θα τοποθετούνται συμπαγή πάνελ περίφραξης μέχρι την ψευδοροφή, ενώ κατά τη διάρκεια των εκσκαφέων οι επιφάνειες θα ραντίζονται τακτικά με νερό και θα τοποθετηθούν περιμετρικά του χώρου συμπαγή πάνελ περίφραξης ύψους δύο μέτρων για περιορισμό της σκόνης, του θορύβου και γενικότερα της οχληρίας. Επιπρόσθετα, η συλλογή των μπάζων θα γίνεται σε τακτά χρονικά διαστήματα, είτε διά χειρός είτε με τη χρήση χοάνων, οι οποίες θα καταλήγουν σε κάδους απορριμμάτων.
Ο Μ. Δαμιανός παραδέχεται πάντως ότι «η δημιουργία εργοταξίου θα επηρεάσει την πρόσβαση των ασθενών του ΝΑΜ ΙΙΙ». Αναφέρει ωστόσο ότι «γίνεται προσπάθεια από τον ΟΚΥπΥ για εξεύρεση χώρου στάθμευσης για κάλυψη των αναγκών του».